Nel 1480 il 'guardiano' Giacomo Rizzo e i compagni disciplinati decidono per "beneficio et augumento" della scuola di San Rocco di aggregarsi con l'omonima scuola esistente nella chiesa dei (Frari). Il 31 agosto il Consiglio di dieci riconosce quest'ultima come scuola grande e autorizza l'unione, a condizione che resti nella chiesa di San Zulian l'immagine di San Rocco e vi sia continuata la devozione. La scuola piccola di San Rocco in San Zulian verrà quindi designata con il nome di "San Rocco piccolo" o "San Rocheto", contraddistinguendosi in tal modo dalla scuola grande di San Rocco ai Frari.
La 'mariegola', i cui primi sedici capitoli risalgono al 1497, sottolinea l'importanza della buona condotta - è prevista una multa di 3 soldi per chi pronuncia parole disoneste - e della solidarietà. Particolare attenzione per gli infermi che devono essere visitati, vegliati e soccorsi al bisogno, con i mezzi propri dei confratelli se la cassa è vuota. I poveri sono sepolti a spese della confraternita. Fra le pratiche devote: ogni mercoledì messa per i defunti, con la partecipazione di 'gastaldo' e 'banca', il capitolo parrocchiale deve celebrare una messa cantata accompagnata dagli organi ogni terza domenica e nelle feste di San Rocco il 16 agosto e di San Nicolò il 6 dicembre.
Un inventario dei beni della scuola del 1533 annovera una "mariegola coverta de veludo chremesin con uno san Rocho d'arzento suso con la sua chasseta de noghera", due 'pennelli' ossia stendardi processionali con "San Rocco" e "San Nicolò" e una pala dell'altare con "San Rocho, san Sebastiano et san Christoforo". L'inventario dei beni del 1624 aggiunge due quadri grandi in tela con cornice con la vita di San Rocco: si tratta presumibilmente di quelli rappresentanti "San Rocco cura gli appestati" e "San Rocco in carcere" opere di Sante Peranda, eseguite nel 1595, ed ancora in loco.
Nell'inventario dei beni del 1803 la 'mariegola' risultava conservare parte degli argenti che l'adornavano, fra cui l'effige di San Rocco privo di una gamba.
Nel 1804 la scuola di San Rocco concede che presso il proprio altare si raccolgano pure le compagnie dei devoti del Sacro Cuore e di San Luigi Gonzaga (fondate nel 1785), e acconsente al rifacimento della pala d'altare: Vincenzo Guarana realizza la nuova tela, tuttora in loco, con "San Rocco, il Cuore di Gesù, e i santi Sebastiano e Luigi Gonzaga".
La documentazione archivistica conservataci relativa alla scuola si arresta al 1806; la confraternita è menzionata per l'ultima volta nella visita pastorale del patriarca Flangini del 1803. La confraternita si estingue nel 1807 in concomitanza con la concentrazione della parrocchia di San Zulian in quella di San Marco.