Sulla scia aperta da fra' Paoluccio camminarono uomini straordinari, che brillarono per santità di vita, dottrina e predicazione e che vissero presso il Convento, come san Bernardino da Siena, che vi istituì uno "Studium generale", san Giovanni da Capestrano, che a Monteripido compì l'anno di noviziato, san Giacomo della Marca, che vi dimorò a lungo e ricevette all'Ordine francescano uno stuolo di giovani universitari trascinati dalla sua eloquenza e dalla forza interiore della sua personalità.
A Monteripido, nel 1462, nacque anche l'idea dei monti di pietà: frate Barnaba Manassei da Terni, frate Michele Carcano da Milano, frate Fortunato Coppoli da Perugia, il Beato Bernardino da Feltre ne furono gli ardenti propagatori.
Nel 1490 fu affidato ai frati dell'Osservanza il compito di rinnovare il catasto di Perugia e ai primi del 1500 il pittore Raffaello saliva il colle per stipulare il contratto per "l'Incoronazione di Monteluce"; anche Pietro Vannucci detto il Perugino lavorava a diverse opere, attualmente conservate alla Galleria nazionale dell'Umbria di Perugia.
Nel 1517 il Convento entrò a far parte della Provincia umbra dei frati minori dell'Osservanza. Dalla metà del Seicento vi risiedettero circa 60 frati, facendo di Monteripido uno degli insediamenti più attivi e vivaci della Provincia Serafica.
Per le esigenze dello "Studium generale", negli anni 1754-1769 fu costruita la monumentale Biblioteca, il cui patrimonio di codici e di incunaboli costituisce ancora oggi una delle acquisizioni più prestigiose della Biblioteca comunale Augusta di Perugia, avvenuta a seguito delle demanazioni napoleoniche.
I secoli XVIII e XIX furono piuttosto turbinosi: prima la soppressione napoleonica, poi quella del 1860, dispersero, infatti, i frati e le loro opere. Nel 1874, però, alcuni frati riacquistarono il Convento, abbandonato dal 1865. In seguito alla mancata ricostituzione del Convento di San Girolamo, a Monteripido fu affidata la cura spirituale del Terzo Ordine Francescano Secolare di Perugia.
Nel 1879 venne costituito il nuovo Collegio Serafico provinciale. Nel 1899 il Comune di Perugia ebbe dai frati del Monte una parte dell'orto per la costruzione del grande serbatoio dell'acquedotto di Nocera Umbra.
Attualmente, presso il Convento, vive una comunità francescana di sette frati, che anima, tra l'altro, una "Fraternità universitaria", aperta agli studenti italiani e stranieri.