Dalla metà del XVI secolo fino a tutto il 1860, come nel resto dello Stato della Chiesa, sopravvissero a lungo i feudi, i cui signori erano stati però privati, fin da epoche assai lontane, di quasi tutti i privilegi. Nessun cambiamento di rilievo dell'assetto amministrativo si verificò fino al 1809, anno in cui vi fu l'annessione dello Stato della Chiesa all'Impero francese. Fino a tale anno la Diocesi di Perugia faceva parte della Provincia dell'Umbria; con le variazioni territoriali introdotte sotto il nuovo dominio, il territorio dello Stato fu diviso in dipartimenti, poi in circondari e in cantoni, conservando come unità amministrativa di base il comune. La Diocesi di Perugia venne cosí a far parte del dipartimento del Trasimeno e a comprendere il cantone urbano e i cantoni in cui il territorio rurale di Perugia fu suddiviso, Passignano, Panicale, Fratta (l'attuale Umbertide) e Marsciano, e alcuni comuni dei cantoni di Deruta, Castiglione del Lago e Città della Pieve.
Restaurato il potere pontificio, Pio VII, con motu proprio del 6 luglio 1816, volle modificare la ripartizione territoriale e la struttura amministrativa dello Stato. Il territorio, esclusa Roma e i suoi territori suburbani (Comarca), fu ripartito in 17 delegazioni, dette anche province; ogni delegazione fu suddivisa in distretti, poi in governi e in vice-governi, dei quali facevano parte le comunità (o comuni), che erano distinte in principali e appodiate. Il territorio della Diocesi fu compreso nei distretti di Perugia (comuni del governo di Perugia e alcuni dei governi di Castiglione del Lago, Città della Pieve, Passignano e Fratta) e Todi (governi del comune di Marsciano). Il successivo motu proprio del 21 dicembre 1827, emanato dal papa Leone XII, istituì le podesterie in luogo dei vice-governi come organismo intermedio tra le comunità e i governi mentre, a partire dal 1831, furono poste le basi per l'organizzazione di una amministrazione provinciale. Fu, infatti, stabilito che il territorio dello Stato, eccetto Roma, la Comarca, le province di Viterbo, Civitavecchia e Orvieto, che costituivano una circoscrizione a parte cui erano conservati antichi privilegi, fosse ripartito in 16 province riunite in 4 legazioni; le province erano suddivise in governi e questi in comuni. Il territorio della Diocesi di Perugia nel 1850 risultava tutto compreso nella Provincia di Perugia (eccettuata la Parrocchia di Sant'Egidio in Poggio Aquilone (Orvieto) e comprendeva quasi interamente il territorio dei comuni di Perugia, Corciano, Deruta, Fratta, Liscione Niccone, Magione, Marsciano, Passignano, Piegaro, Tuoro e Torgiano, oltre alle parrocchie di San Cristoforo in Ospedalicchio nel Comune di Bastia, Santa Maria Maddalena in Castiglione del Lago, Santa Maria di Piana e San Michele arcangelo dell'Isola Maggiore nel Comune di Castiglione del Lago, San Vito e San Modesto di Montale nel Comune di Panicale.
Papa Leone XIII nel 1882 elevò la Diocesi a titolo arcivescovile e Paolo VI, a sua volta, la promosse a servizio delle diocesi vicine col rango di metropolitana.
Nel 1986 è stata unificata a Perugia la Diocesi di Città della Pieve per cui il nome attuale è Arcidiocesi di Perugia - Città della Pieve.
Nel 2009 aveva una superficie di 1900 km² e contava 154 parrocchie; i sacerdoti diocesani residenti erano 196, i religiosi 84, i membri degli istituti religiosi maschili 127, degli istituti femminili 521, gli istituti di educazione 32, di beneficienza 20. Secondo rilevazioni del 2004 aveva 229.500 battezzati su 232.500 abitanti.

Tratto da: G. LETI, L. TITTARELLI, Le fonti per lo studio della popolazione della diocesi di Perugia. Dalla metà del XVI secolo al 1860, Gubbio, 1976, pp.1-4; http://it.wikipedia.org/wiki/Arcidiocesi_di_Perugia-Città_della_Pieve