[cfr.: "Archivi storici in rete della provincia di Taranto", Scheda Soggetto produttore dell'Archivio storico comunale di Montemesola: http://archivistorici.provincia.ta.it/scheda_dettaglio.asp?Id=57].
La legge 8 agosto 1806, n. 132, produsse importanti innovazioni nell'amministrazione del Regno, dividendo il territorio in province e distretti, nell'ambito dei quali furono ripartiti i comuni. Il decreto del Regno di Napoli 4 maggio 1811, n. 922, emanato da Giuseppe Napoleone per fissare la circoscrizione delle province napoletane, incluse il comune di Montemesola nel distretto di Taranto in provincia di Terra d'Otranto [cfr. F. ASSANTE, 'Città e campagne nella Puglia del secolo XIX', in 'Quaderni Internazionali di Storia economica e sociale', Genève, Librairie Droz, 1975, p. 339]. Nel decreto del Regno delle due Sicilie 1 maggio 1816 n. 360 Montemesola figurava tra i comuni inclusi nel circondario di Grottaglie appartenente al distretto di Taranto in provincia di Terra d'Otranto; secondo la classificazione adottata dal decreto, Montemesola, con i suoi 1214 abitanti, era classificato tra i comuni di terza classe, ossia quelli con una popolazione inferiore ai 3000 abitanti. L'operato degli organi amministrativi di Montemesola era sottoposto allo stretto controllo dell'intendente della provincia di Terra d'Otranto sotto gli ordini del ministro dell'Interno; con poteri più limitati, l'attività di vigilanza era esercitata anche dal sottointendente del distretto di Taranto.
Tra il 1923 e il 1937, nell'ambito di una complessiva ridefinizione dell'assetto amministrativo del Regno d'Italia, furono approvate una serie di modifiche nella circoscrizione interna alla provincia di Terra d'Otranto, che perse la sua antica unità e fu frazionata nelle tre province di Brindisi, Lecce e Taranto. Con decreto del Regno d'Italia 2 settembre 1923 n. 1911 fu istituita la provincia di Taranto cui furono annessi tutti i comuni fino ad allora inclusi nell'omonimo distretto (dal 1865 circondario), tra i quali il comune di Montemesola.
In seguito all'adozione dell'ordinamento comunale fascista disposta, per i comuni con popolazione fino a 5000 abitanti, con legge 4 febbraio 1926 n. 237, estesa poi a tutti i comuni con legge 3 settembre 1926 n. 1910, il Comune di Montemesola fu amministrato da un podestà di nomina regia che ereditò le competenze esercitate dal consiglio, dalla giunta e dal sindaco. Con la caduta del fascismo e l'emanazione del regio decreto legge 4 aprile 1944 n. 111, presso il Comune furono ripristinati gli organi del sindaco e della giunta riservandone la nomina al prefetto della provincia di Taranto; ai sensi del decreto legislativo luogotenenziale 7 gennaio 1946 n. 1 si insediò anche il Consiglio comunale e si ristabilì il sistema elettivo e di nomina dei tre organi vigente prima del 1926.
Secondo il disposto della legge 8 giugno 1990 n. 142, il Comune di Montemesola ha sancito la propria autonomia regolamentare dotandosi di uno statuto, acquisito in data anteriore all'emanazione della legge 3 agosto 1999 n. 265 (Disposizioni in materia di autonomia e ordinamento degli enti locali) e in attesa di aggiornamento. Ai sensi della legge 25 marzo 1993 n. 81, il sindaco di Montemesola è eletto direttamente dai cittadini e nomina i membri della giunta municipale.
Nel 2001 la popolazione residente nel comune ammontava a 4277 abitanti (ISTAT, 14° censimento della popolazione e delle abitazioni, 21 ottobre 2001).